菊花严重的病害就是菊花叶斑病，该病从植株的下部叶片发生，叶片上病斑散生。初为退绿斑，而后变为褐色或黑色，病斑逐渐扩大成为圆形、椭圆形或不规则状。直径2毫米至10毫米，逐渐扩大增多，从植株下面向上蔓延，严重时病斑联合成片，叶枯下垂，倒挂于茎上，影响整个植株。
该病病菌以分生孢子器在病株或土壤中的病残体上越冬，由风雨传播，气孔侵入。每年4月至10月为发病期，尤其5月至8月高温潮湿季节发病严重。所以平时应加强管理，浇水时忌喷溅浇灌弄湿下部叶片。栽植不要太密，加强通风透光。一旦发现病叶要及时除去销毁，并喷洒65％代森锌可湿性粉剂500倍液，或75％百菌清可湿性粉剂500倍液，或10％的波尔多液每隔7天至10天喷1次。连续3次至4次即可控制病情，或在发病前喷50％托布津1000 倍液，或50％多菌灵500倍液均有良好的防治效果。
菊花常见的害虫有蚜虫和红蜘蛛。蚜虫自幼苗开始到开花结束都有发生，春季发芽时蚜虫出现，群栖在嫩茎叶上，吸食液汁。秋季可繁殖数十代，危害芽心与花瓣。被害植株发黄变形，花蕾败坏，花期缩短。发现蚜虫后用40％氧化乐果1500 倍液至3000 倍液，25％亚铵硫磷1000 倍液，50％灭蚜虫松剂1500 倍液，均可。红蜘蛛多发生在夏季高温干燥季节，潜伏干、叶背，刺吸叶汁，使叶片干黄枯花。
花期也危害花瓣，使花朵很快凋谢。发现红蜘蛛危害后，可用40％氧化乐果1000 倍液，或80％敌敌畏1000 倍液，或40％三氯杀螨醇1000 倍液至1500 倍液，均有显著效果。夏季高温干燥时候，常用清水喷雾也有一定防治作用。
