2.1 重治灾、轻预防
由于前期病虫害发生面积少、为害轻，因而不够重视，容易错失最佳防治时机，造成受害面积增加、为害程度加重，甚至引发公共事件而不得不被动防治，从而浪费大量的人力、财力。
2.2 监测能力有待加强
一线监测人员数量较少，且专业能力不足，不能及时、准确地掌握有害生物发生情况，并采取科学的防治措施。
2.3 检疫力量薄弱
一方面，基层人员较为缺乏，现有检疫人员与巨大的工作量不匹配，致使检疫容易出现疏漏，人为传播现象依然存在[1]。2016年，睢宁县开始实施“百村万树”工程，短时间内大量苗木入境，只能依靠跟踪复检来进行检疫，一定程度上给检疫性、危险性林业有害生物的入侵开启了方便之门；另一方面，由于检查站的撤销无法实施路检，会出现刻意避开复检的情况，增加了检疫难度。
2.4 防治手段落后
长期以来，主要依靠药剂防治林业有害生物，而且地面防治大多属于应急除治，药剂中往往复配高效氯氰菊酯等，既会对环境造成污染，又会提升有害生物的抗药性。另外，由于技术人员年龄老化，习惯使用旧方法、旧设备，缺乏对新技术、新设备的使用，如植保无人机等。
2.5 良种培育与造林脱节
林业部门之间长期缺乏协调，造林规划设计时较少考虑病虫害问题，选择树种时往往仅考虑经济效益或景观效果，良种培育不足，预防机制差，使得病虫害防治工作长期处于被动局面。
2.6 防治经费短缺
受经费短缺的制约，难以构建一支专业素质能力较高的防治队伍，加之基层基础设施不足，相关设备陈旧老化，难以实现新形势下物联网新一代信息技术在林业有害生物监测和防控中的应用。人工剪网、围草诱蛹、人工捕捉成虫、灯光诱杀、天敌控制等传统防治措施不适用于大面积除治，严重影响了防控效果。